雅思终于考完了md，这次找不到借口因为别的东西不想敲代码了（虽然我感觉tmd听力还是过不了，运气好希望能一次过吧（虽然每次感觉运气好的时候运气都不好））。 无论如何，英语的学习算是告一段落了，就算运气不好的话，单科重考我认为还是很有把握的。 所以！接...

这两块代码含量都比较少，大部分通过在线分析就可以出结果 7 PPI分析构建差异表达基因编码的蛋白质之间的相互作用网络，识别关键调控蛋白质或蛋白质复合物。 输出的是PPI网络图及其分析结果，发现核心蛋白质。 在线分析网站：356 items (Maca...

5. 富集分析通过前文我们可以提取出差异基因，然而差异基因的数量较多，对其进行分析会十分冗长，因此我们可以采取富集分析的方式进行归类。富集的意思是表示差异基因或者差异物质中注释到某个代谢通路的基因或者物质数目在所有差异基因或者物质中的比例显著大于背景...

上游分析1. 安装linux这就不多说了，自己搞一个虚拟机，我用的是Centos7。 ps：如果使用的是学校集群的话，注意在修改密码中改一下自己的密码，开启后账号为：root，密码自定义（注意是暗文，你敲进去是不会显示的）结束了enter即可 2. ...

拟时序分析在进行了聚类之后，其实各细胞是否具有同种生存状态是未知的。拟时序分析的目的就在于将细胞分为不同的分支，将各点（细胞）体现在不同的时间坐标中，从而了解各细胞的状态定位 在做拟时序分析的时候，采取的是机器学习方法（无监督和有监督），因此需要一定...

单细胞测序分析3. 差异基因(DEG)在单细胞RNA测序分析中，聚类之后筛选差异基因的主要目的是为了深入理解不同细胞群体之间的生物学差异。首先先看我们筛选出来的数据并对其进行解释 **p_val：**基因表达量差异P值（一般不看这个） **p_va...

单细胞测序分析1. 测出数据部分在通过前文的处理之后，我们得到了两个输出文件，分别为raw_feature_bc_matrix和filter_feature_bc_matrix。前者为原始数据，后者为cellranger经过自己处理后的数据，后续的分...

模型评估与选择评估方法留出法就是目前用的划分数据集的办法，注意是互斥的数据集 交叉验证分为k个子集，用k-1作为训练集，剩下的作为测试集 性能度量回归最常用的是均方误差 定义混淆矩阵： 正例 反例 TP（预测为真，实际为真） FN（预测为...

Kaggle比赛：Titanic - Machine Learning from Disaster链接：https://www.kaggle.com/competitions/titanic 成绩758/15641（2024.4.21）： 还算不错吧...

天池-工业蒸汽量排放预测4链接：工业蒸汽量预测_学习赛_赛题与数据_天池大赛-阿里云天池的赛题与数据 (aliyun.com) 特征优化合成特征从一个或多个输入特征衍生而来的特征，包括以下类型 将一个特征与其本身或其他特征相乘（特征组合） 两个特...